User:Lemiku/DNA–DNA 杂交

DNA DNA杂交 一般指的是分子生物学技术，这种技术措施的程度的遗传之间的相似性池的 DNA 序列。它通常用来确定遗传距离之间的两种生物。这已被广泛用于亲缘关系和分类的。

方法[编辑]

DNA的一个有机体的标记，然后混合的未标记的DNA要比反对。该混合物培育以允许的DNA链分离，然后冷却，形成新的混合动力双链DNA。杂化的序列具有高度的相似性将更加坚定，并且需要更多的能源，将它们分离的：即它们的独立时加热的，在温度高于不同的序列，这一过程称为"DNA熔化的"。

评估的熔配置文件的杂交的DNA、DNA双链绑列和混合物被加热的小步骤。在每一个步骤，列是用；以序列熔化成为单一链和洗掉柱。气温在其标记的DNA下列反映量的相似之间序列(和自杂交的样本用作一种控制)。这些结果是结合的程度来确定的遗传之间的相似性的生物体。

用动物学[编辑]

当几个物种相比，这种方式，似值允许的种类安排在系统树；它因此是一种可能的方法进行分子分类学的。查尔斯南方和 Jon Ahlquist，开拓者的技术、使用DNA DNA杂交审查的亲缘关系的相关联的( 南方–Ahlquist分类)和灵长类动物。^[1]^[2]

使用微生物学[编辑]

DNA DNA杂交的黄金标准，以区分的细菌菌种的，有一个相似值大于70%的指示所比较的菌株属于不同的物种。^[3]^[4]^[5] 在2014年，一个阈值的79%相似曾建议单独的细菌亚种。^[6]

更换通过基因组测序[编辑]

批评者认为，该技术是不准确的，为了比较密切相关的物种，因为任何试图测量之间差别的直向同源序列之间的物体是不堪重负的杂交的旁系同源列在一个有机体的基因组中。引证错误：<ref>标签中未填内容的引用必须填写name属性 DNA测序和计算比较顺序现在一般的方法，用于确定遗传距离，虽然技术仍在使用微生物学来帮助识别的细菌。引证错误：<ref>标签中未填内容的引用必须填写name属性

现代的方法是进行DNA DNA杂的硅使用完全或部分地测序的基因组中。引证错误：<ref>标签中未填内容的引用必须填写name属性该 GGDC 开发 DSMZ 是最准确的知的工具，用于计算髋关节发育不良的-类似的价值观。引证错误：<ref>标签中未填内容的引用必须填写name属性除其他算法的改进，它解决的问题旁系同源序列的通过仔细筛选他们从之间的匹配的两个基因组序列。

也参看[编辑]

参考文献[编辑]

^ Genetic Similarities: Wilson, Sarich, Sibley, and Ahlquist
^ C.G. Sibley & J.E. Ahlquist. The Phylogeny of the Hominoid Primates, as Indicated by DNA–DNA Hybridization. Journal of Molecular Evolution. 1984, 20 (1): 2–15. PMID 6429338. doi:10.1007/BF02101980. |author=和|last=只需其一 (帮助)
^ Brenner DJ. Deoxyribonucleic acid reassociation in the taxonomy of enteric bacteria. International Journal of Systematic Bacteriology. 1973, 23 (4): 298–307. doi:10.1099/00207713-23-4-298. |author=和|last=只需其一 (帮助)
^ Report of the ad hoc committee on reconciliation of approaches to bacterial systematics. International Journal of Systematic Bacteriology. 1987, 37 (4): 463–464. doi:10.1099/00207713-37-4-463.
^ Notes on the characterization of prokaryote strains for taxonomic purposes. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2010, 60 (Pt 1): 249–266. PMID 19700448. doi:10.1099/ijs.0.016949-0.
^ Complete genome sequence of DSM 30083^T, the type strain (U5/41^T) of Escherichia coli, and a proposal for delineating subspecies in microbial taxonomy. Standards in Genomic Sciences. 2013, 9: 2. PMC 4334874 . PMID 25780495. doi:10.1186/1944-3277-9-2.

[[Category:DNA]] [[Category:分子生物学]]

[1] Genetic Similarities: Wilson, Sarich, Sibley, and Ahlquist

[2] C.G. Sibley & J.E. Ahlquist. The Phylogeny of the Hominoid Primates, as Indicated by DNA–DNA Hybridization. Journal of Molecular Evolution. 1984, 20 (1): 2–15. PMID 6429338. doi:10.1007/BF02101980. |author=和|last=只需其一 (帮助)

[Brenner1979-3] Brenner DJ. Deoxyribonucleic acid reassociation in the taxonomy of enteric bacteria. International Journal of Systematic Bacteriology. 1973, 23 (4): 298–307. doi:10.1099/00207713-23-4-298. |author=和|last=只需其一 (帮助)

[Wayne1987-4] Report of the ad hoc committee on reconciliation of approaches to bacterial systematics. International Journal of Systematic Bacteriology. 1987, 37 (4): 463–464. doi:10.1099/00207713-37-4-463.

[Tindall2010-5] Notes on the characterization of prokaryote strains for taxonomic purposes. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2010, 60 (Pt 1): 249–266. PMID 19700448. doi:10.1099/ijs.0.016949-0.

[doi:10.1186/1944-3277-9-2-6] Complete genome sequence of DSM 30083^T, the type strain (U5/41^T) of Escherichia coli, and a proposal for delineating subspecies in microbial taxonomy. Standards in Genomic Sciences. 2013, 9: 2. PMC 4334874 . PMID 25780495. doi:10.1186/1944-3277-9-2.

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